การรวมข้อมูลเซลล์เดียวหลายรูปแบบ

การรวมข้อมูลเซลล์เดียวหลายรูปแบบ
  • ข่าวและความคิดเห็น
  • โพสต์เมื่อ:

การทดสอบเซลล์เดียว

เทคโนโลยีชีวภาพทางธรรมชาติ (2023) เพื่ออ้างอิงบทความนี้

  • 131 เข้าถึง

  • 7 อัลท์เมตริก

  • เมตริก รายละเอียด

เรื่อง

ข้อมูลเซลล์เดียวจาก RNA-seq, การเข้าถึงโครมาติน, DNA เมทิลเลชัน และรูปแบบอื่นๆ สามารถรวมเข้าด้วยกันได้อย่างง่ายดายโดยใช้วิธีการใหม่สองวิธี

ด้วยการพัฒนาอย่างรวดเร็วของเทคโนโลยีใหม่สำหรับการวิเคราะห์เซลล์เดียว วิธีการรวมประเภทข้อมูลต่างๆ ให้เป็นคำอธิบายแบบรวมของประเภทและสถานะของเซลล์ยังคงเป็นความท้าทายหลักในด้านนี้ การรวมชุดข้อมูลเหล่านี้เข้ากับการอ้างอิงเซลล์เดียวขนาดใหญ่ที่มีคำอธิบายประกอบอย่างดีจะเป็นโซลูชันที่มีแนวโน้ม สองการศึกษาใหม่ เทคโนโลยีชีวภาพทางธรรมชาติ1,2 เรานำเสนอวิธีการคำนวณสำหรับการรวมชุดข้อมูลเซลล์เดียวที่วัดโปรไฟล์โมเลกุลที่แตกต่างกัน วิธีนี้ผสานรวมและถ่ายโอนฉลากประเภทเซลล์จากการอ้างอิงการแสดงออกของยีนไปยังชุดข้อมูลเซลล์เดียวที่หลากหลายได้อย่างน่าเชื่อถือ ข้อได้เปรียบหลักคือวิธีนี้ไม่ได้ตั้งสมมติฐานเกี่ยวกับการแปลงระหว่างคุณลักษณะต่างๆ

การแสดงตัวอย่างเนื้อหาการสมัครสมาชิกที่เข้าถึงได้ผ่านสถาบันของคุณ

ตัวเลือกการเข้าถึง

เข้าถึงวารสาร Nature และวารสาร Nature Portfolio อีก 54 ฉบับ

รับ Nature+ การสมัครรับการเข้าถึงออนไลน์ที่คุ้มค่าที่สุด

$29.99 / 30 วัน

ยกเลิกได้ตลอดเวลา

สมัครสมาชิกวารสารนี้

รับ 12 ฉบับพิมพ์และการเข้าถึงออนไลน์

$209.00 ต่อปี

เพียง $17.42 ต่อคำถาม

เช่าหรือซื้อบทความนี้

รับบทความนี้นานเท่าที่คุณต้องการเท่านั้น

$39.95

ราคาอาจมีภาษีท้องถิ่นที่คำนวณเมื่อเช็คเอาท์

รูปที่ 1: การรวมข้อมูลเซลล์เดียวหลายรูปแบบ

อ้างอิง

  1. เฮา, YTS และคณะ ณัฐ. เทคโนโลยีชีวภาพ. https://doi.org/10.1038/s41587-023-01767-y (2566).

    บทความ PubMed Google Scholar

  2. Ghazanfar, CG และคณะ ณัฐ. เทคโนโลยีชีวภาพ. https://doi.org/10.1038/s41587-023-01766-z (2566).

    บทความ Google Scholar

  3. Zhu, C., Preissl, S. & Ren, B. ณัฐ. วิธีการ 1711–14 (2020).

    บทความ CAS PubMed Google Scholar

  4. Stuart, T., Srivastava, A., Madad, S., Lareau, CA & Satija, R. ณัฐ. วิธีการ 181333–1341 (พ.ศ. 2564).

    บทความ CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

  5. ฟาร์ม JM และคณะ ณัฐ. เทคโนโลยีชีวภาพ. 371458–1465 (2019).

    บทความ CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

  6. คลาร์ก เอสเจ และคณะ ณัฐ. มาตรการ 12534–547 (2560).

    บทความ CAS PubMed Google Scholar

  7. โบเดนมิลเลอร์ บี. และคณะ ณัฐ. เทคโนโลยีชีวภาพ. 30858–867 (2555).

    บทความ CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

  8. ชิ เอ็ม และคณะ พิมพ์ล่วงหน้า โปรโตคอล.io https://doi.org/10.17504/protocols.io.bukqnuvw(2021).

  9. Mimitou, EP และคณะ ณัฐ. วิธีการ 16409–412 (2562).

    บทความ CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

  10. Danenberg, E. และคณะ ณัฐ. ยีน 54660–669 (2565).

    บทความ CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

  11. Janesick, A. และคณะ พิมพ์ล่วงหน้า ไบโอRxiv https://doi.org/10.1101/2022.10.06.510405(2022).

  12. วู, SZ และคณะ ณัฐ. ยีน 531334–1347 (พ.ศ. 2564).

    บทความ CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

ดาวน์โหลดอ้างอิง

ข้อมูลผู้แต่ง

ผู้แต่งและสังกัด

  1. Graduate Group of Genomics and Computational Biology, Perelman School of Medicine, University of Pennsylvania, Philadelphia, Pennsylvania, USA

    มิเชล วาย.วาย. ลี

  2. ภาควิชาพันธุศาสตร์ University of Pennsylvania, Philadelphia, Pennsylvania, USA

    มิเชล วาย.วาย. ลี

  3. ภาควิชาชีวสถิติ ระบาดวิทยาและสารสนเทศ Perlman School of Medicine, University of Pennsylvania, Philadelphia, PA, USA

    หมิงเหยา ลี

ผู้เขียนที่เกี่ยวข้อง

การโต้ตอบกับ Li Mingyao

ประกาศจรรยาบรรณ

การแข่งขันความสนใจ

ผู้เขียนประกาศไม่มีผลประโยชน์ที่แข่งขันกัน

เกี่ยวกับบทความนี้

อ้างอิงบทความนี้

Lee, MYY, Li, M. การรวมข้อมูลเซลล์เดียวหลายรูปแบบ ไม่ใช่ไบโอเทคอล (2566). https://doi.org/10.1038/s41587-023-01826-4

ดาวน์โหลดการอ้างอิง

เนื้อหาที่เกี่ยวข้อง

อ่านเพิ่มเติม

Author:

Leave a Reply